西元十八世紀末年，蕭姓祖先遠從台灣府諸羅縣布袋嘴來到台江菅埔，搭寮農墾建村落時，為求平安而供奉「家祠神明：觀音佛祖、中壇元帥」和設置「五營土崙」(埋下金、銀、銅、鐵、珠、玉、瑪瑙等七寶入神)以保境安民。後來西側筏仔頭王姓祖先供奉寄放的神明：「朱府千歲」屢顯神威保佑村民，而逐漸成為村落的主神。同時村民與東八堡七寮為感恩學甲慈濟宮保生大帝曾顯化成老人自書訴狀，替先民化解墾戶苛重的租稅剝削與霸佔。逐於每年保生大帝誕辰過後，七寮村民共同恭迎南下遶境祭拜。

早期祖先草創時期，由於村落小且生活困苦，故無法建築神廟祭祀，所以每逢神明誕辰時，都臨時在公地上搭布棚祭祀。直到1969年才由蕭原興與各委員成立「建廟委員會」，共同協力籌集經費完成舊有「代天府」神廟。神明才正式擁有固定的廟宇展現神威，庇佑村落興旺發展。惟後來經歷二十餘年歲月的風雨侵蝕，導致廟宇的牆壁浮雕和紋飾剝落，廟頂的琉璃瓦和鳥翼翹起的飛簷亦破損或斷落。因此，1996年由蕭順治與各委員共同成立「代天府」神廟重建委員會。由蕭順治捐獻新廟地(舊廟東側)，蕭富雄負責規劃新廟外貌與內型道觀的設計和建材的購置施工至2001年完成正殿入火。2004年以後由蕭國財與各委員成立「管理委員會」，陸續增購南側新廟埕、東側老樹園和增建兩側廟室。2016年廟室竣工，至2017年11月5日舉辦謝土大典，正式完成規模宏偉壯觀且美麗的「代天府」新廟。